填料基本知識方面 | ||
序號 | 客戶問題 | 匯研答案 |
1 | 為什么純化時目標物不與介質(zhì)結合,或結合量較低? | 1.上樣量過載,降低上樣量,2.上樣速度過快,降低上樣流速,3.蛋白或脂類在介質(zhì)中聚集,及時有效地清洗介質(zhì)或更換新的介質(zhì),4.目標物不帶電或與介質(zhì)帶同樣的電荷,篩選合適的結合緩沖液,5.樣本或平衡液中鹽濃度和pH不正確,檢查樣品和平衡液中的電導和pH,6.選用了錯誤的緩沖液,參考緩沖液選擇表,7.樣品中加入了不合適的去污劑,檢查樣品中是否有不合適的去污劑 |
2 | 洗脫時沒有收集到目標物,或只收集到少量目標物,怎么辦? | 1.目標物沒有與介質(zhì)結合或結合量較少,先確認目標物是否與介質(zhì)結合,2.洗脫條件不合適,洗脫液洗脫能力不夠,加大鹽濃度和調(diào)整洗脫液pH,3.洗脫時間不夠,降低流速,延長洗脫液的保留時間,4.洗脫體積過小,加大洗脫體積,5.目標物在洗脫液條件下出現(xiàn)聚集沉淀,檢測目標物在洗脫液條件(鹽濃度和pH)下的溶解度和穩(wěn)定性。 |
3 | 目標物純度較低怎么辦? | 1.樣品沒有經(jīng)過前處理,樣品上柱前必須要經(jīng)過離心或過濾,2.樣品粘度過高,用平衡液適當?shù)南♂寴悠罚档驼扯龋?.洗雜不徹底,加大洗雜體積直至基線平穩(wěn)并與平衡液一致,4.雜質(zhì)蛋白或脂類在介質(zhì)中聚集沉淀,及時有效地清洗介質(zhì),5.洗脫條件不佳,優(yōu)化洗脫條件,6.目標物出現(xiàn)降解,檢測目標物的穩(wěn)定性,7.柱料裝填效果不佳,重新裝填或購買,8.分離柱頂部有較大儲樣體積,重新裝柱或降低儲樣體積,9.介質(zhì)中有微生物生長,介質(zhì)使用完后,請及時正確保存介質(zhì) |
4 | 哪些因素會引起介質(zhì)載量下降? | 1.上樣速度過快,降低上樣流速,2.蛋白或脂類在介質(zhì)中聚集,導致載量下降,及時清洗介質(zhì),3.使用次數(shù)過多,配基被氧化或脫落,及時清洗介質(zhì)或更換新介質(zhì) |
5 | 什么原因會造成色譜峰上升緩慢? | 介質(zhì)裝填太松,重新裝柱 |
6 | 什么原因會引起色譜峰拖尾? | 介質(zhì)裝填太松,重新裝柱 |
7 | 引起柱床有裂縫或干涸的原因有哪些? | 出現(xiàn)泄露或大體積氣泡引入,檢查管路是否有泄露或氣泡,重新裝柱 |
8 | 液流較慢,怎么辦? | 1.蛋白或脂類聚集,及時清洗介質(zhì)或濾膜,2.蛋白沉淀在介質(zhì)中,調(diào)整平衡液和洗脫液組分,以維持目標物的穩(wěn)定性和介質(zhì)的結合效率,3.分離柱中微生物生長,所用試劑必須經(jīng)過過濾和脫氣; |
9 | 柱子管路有氣泡,如何處理? | 柱管里面沒有問題,那是壓柱的時候溢出來的。 |
10 | 客戶反映柱底分布器有漏液情況,怎么處理? | 若是新柱底分布器,則檢查柱底分布器篩板和柱內(nèi)套桿是否有松動;若不是,則檢查是否有密封圈老化的可能。最后檢查篩網(wǎng)是否有破損 |
11 | Bio-Gel P-100填料,16/70裝柱,柱高50-60cm,流速0.2ml/min下,下出口收集液有膠的存在 | 該款填料耐壓較低,不適合裝得較高,后換用16/20的柱子,裝柱高度在13cm,流速0.12ml/min壓柱,控制壓力在0.1MPa以內(nèi),沒有漏膠情況出現(xiàn)。 |
12 | 裝柱有什么要求?Ni柱裝柱高度?CHAPS是什么? | 將填料攪拌均勻,裝的時候?qū)⑻盍蠅壕o,要保證里面沒有氣泡。Ni柱裝柱高度一般是20-30cm,最好不要超過50cm。CHAPS是兩性離子非變性去垢劑。 |
13 | 5ml預裝柱直徑及高度是多少? | 空柱5ml直徑17mm. 高37mm,空柱1ml直徑8mm.高37mm |
14 | p100裝填16/70的柱子存在漏膠問題,怎么處理? | 對于p100裝16/70柱的項目,我們裝柱過程中發(fā)現(xiàn)膠面始終不穩(wěn)定,有往下降,流出液中有膠,用的新柱子,分布器濾膜也未出現(xiàn)異常情況,從以上情況判斷,16/70柱不適合裝p100填料。 |
15 | 某蛋白分子量約800kda,用Q柱純化能否掛柱? | 離子柱,調(diào)節(jié)好PH值都能掛柱。只是分子量大的蛋白,空間結構復雜的蛋白,載量會相應的變低。但不影響正常的掛柱洗脫 |
16 | 5ml預裝柱,用的時候上頂蓋噴出來了,該怎么辦? | 這種情況是由于反壓過大造成的。5ml預裝柱的材料耐壓0.5MPa,但是一般壓力超過0.15就可能出現(xiàn)這種情況。建議客戶重新裝柱后減小流速或者稀釋樣品再上樣。 |
填料應用方面 | ||
序號 | 客戶問題 | 匯研答案 |
1 | 目的蛋白6OKD,雜蛋白大于120KD,如何選擇分子篩填料? | 建議選擇200PG,用16/70的柱子。 |
2 | 用來分離纖維低聚糖單體你們哪款單體比較合適?。?/span> | 這個屬于小分子分離純化了,硬膠更適合一些,聚丙烯酰胺凝膠柱。我們的產(chǎn)品推薦用陽離子交換填料試一下。 |
3 | 像我們1cm*20cm的柱子大概需要多少Sephadex G-25填料呀? | 3.14×0.5×0.5×20=15.7ml 我們的G25是干粉,溶脹系數(shù)4-6倍,按照這個比例,只需要3-5g就夠了 |
4 | 分離多肽比較常用的是哪些產(chǎn)品呀? | 我們這邊有客戶走到生產(chǎn)級別的,用的是SP和MMC。 |
5 | 目的蛋白和雜蛋白分子量都是50-500kd要怎么選啊? | 如果雜蛋白和目的蛋白分子量相差不大,那么分子篩產(chǎn)品是無法分離的,可以選擇親和,離子交換或者疏水填料。 |
6 | 賽默飛有款Pierce Zeba快速脫鹽產(chǎn)品,你們的填料能這么用嗎? | 我們的用不了。賽默飛這款相當于超濾離心管。通過離心對蛋白溶液進行置換,以達到脫鹽換液的目的。我們的如果這樣操作,填料會流干,蛋白濃度就會很大,蛋白析出或者變性都有可能。而且該操作可能把填料的孔都堵住,所以不能這么操作。 |
7 | 咨詢脫鹽柱G25填料? | 建議推薦30pg,G25分子篩干粉,分離范圍是1k-5k,葡聚糖聚合是第一代分子篩,試用前要煮沸成濕膠狀態(tài)。而30pg是濕膠狀態(tài),分離范圍是可以,葡聚糖和纖維素具有一定的剛性,屬于第二代分子篩??梢試L試, |
8 | 螯合好的鎳柱填料有哪些及其使用范圍? | 鎳柱有三款填料,IDA、IMAC、TED,具體內(nèi)容請參看最新產(chǎn)品手冊第26-27頁,一般推薦是常規(guī)粒徑的. |
9 | 請問硬膠和軟膠有什么區(qū)別? | 硬膠主要是耐壓比較大,效率高一些,但純化過程對生物活性影響比較大,非特異性吸附,而軟膠反壓較小,可保持生物活性。 |
10 | 一般用離子填料耐高壓,有沒有合適的填料能夠替換GE的30Q??? | 小分子核甘酸純化耐壓大概5bar等,推薦我們的Q-HPR能對標進口,這款填料平均粒徑是37μm,耐壓是5bar,可以嘗試。 |
11 | 之前購買預活化NHS偶聯(lián)效果不太好有沒有其他合適的填料推薦? | 一般推薦客戶使用CNBr填料,主要CNBr和NHS偶聯(lián)的官能團是氨基,但前者偶聯(lián)量更大一些,效果也更好一些。 |
12 | 工藝開發(fā)的時候樣品在高鹽條件下選擇疏水填料,或者 陽離子填料嘗試,但效果不太好怎么辦? | 可以嘗試多模式層析填料摸索合適的洗脫條件。 |
13 | 小鼠IgM用NHS這個填料偶聯(lián)蛋白的比例是多少呀? | 分子量越大的偶聯(lián)量越低,建議1-3mg(IgM)/ml(NHS) |
14 | 想找一款鎳柱填料,之前使用的粒徑是FF,容易堵塞孔載量不高? | 我們公司可以根據(jù)樣品的實際情況做定制化填料,建議使用大顆粒填料如Ni-IDA-BB來避免出現(xiàn)堵塞。 |
15 | 分子篩分離效果不太好是什么原因? | 1、目標蛋白和雜質(zhì)的分子量差異比較小2、裝柱高度在60cm,純化組分分離一般上樣量控制在5%以內(nèi),組群分離控制在30%。 |
16 | 親和鎳純化原核胞外蛋白選擇高分辨率,重力柱可以裝這款填料嗎? | 1、重力柱一般選擇Ni-IMAC-FF,平均粒徑90μm,HP的平均粒徑是37μm,小粒徑分辨率高,同時反壓也比較大,一般重力柱選擇90μm的。 |
17 | 客戶之前用了一下我們的Q柱和Ni柱,都出現(xiàn)了填料發(fā)紅的情況,可以洗掉嗎? | 填料本身是沒有紅色的物質(zhì),確認一下樣品中是否有紅色的雜質(zhì)吸附在微球上,如酚紅或色素等。如果是吸附的雜質(zhì),可以嘗試用高鹽清洗一下。如果還不行,可以嘗試用8M尿素或者1M氫氧化鈉+30%異丙醇清洗。 |
18 | DEAE-6FF填料使用過程中,由于樣品中有添加低濃度的錳離子,在堿處理過程中填料顏色變黑了怎么辦? | 1.將填料用1M HCl浸泡處理24h,然后用純化水洗膠至接近中性,但檢測結果顯示離子載量合格,但蛋白載量僅為合格載量的50%;2.為預防填料變黑,可在2M NaCl處理過后,用純化水沖洗柱子10個柱體積以上,再用0.5M NaOH處理。 |
19 | 我們的30PG和75PG產(chǎn)品一般都能做多少次? | 沒有具體驗證過,分子篩和離子交換產(chǎn)品,理論上是可以使用300-500次,實際上是200次左右,親和填料,理論使用次數(shù)是150-200次,實際上100次左右。具體使用次數(shù)主要還是看樣品清潔度和使用者的習慣及填料保養(yǎng)及清洗狀態(tài)。 |
20 | 什么是嗜硫吸附?Plasmid對閉環(huán)DNA是嗜硫吸附嗎?為什么該填料對開環(huán)DNA不吸附? | 很多個堿基組成DNA鏈,鏈與鏈之間通過二硫鍵結合。我們這個Plasmid填料就是作用在二硫鍵上的。開環(huán)DNA的二硫鍵被打開了,所以填料Plasmid不能吸附開環(huán)DNA。 |
21 | 怎樣去除樣品中的色素? | 1.30PG脫鹽柱處理。2.Q柱,結合模式。3.SP柱,流穿模式。 |
22 | 直徑450的,柱高28cm 可以做G25脫鹽柱嗎?上樣量呢? | 可以做脫鹽柱,不過建議不要裝太高,裝太高了流速會很慢,建議不超過20cm。上樣量研發(fā)階段30%,生產(chǎn)級別20-25%。 |
23 | 1.請問EAH的15個原子間隔臂是peg形式的還是烷基? 2.請問NHS填料用普通異丙醇保存就可以了嗎?3.G75 和75PG這兩個性質(zhì)有什么差異嗎? | 1.親水鏈。2.沒用過的可以。3.G75原材料是葡聚糖,75PG原材料是瓊脂糖+葡聚糖+纖維素 |
24 | 1.溴化氫填料時間長了,結合抗原能力下降?2.蛋白液中含有尿素,對填料的偶聯(lián)影響有多大?3.4FF的孔徑是多少? | 1.6個月后載量會降低30%-40%。2.確保偶聯(lián)時的 pH 和鹽濃度與 B 液一致:0.2M NaHCO3、0.5 M NaCl,調(diào)節(jié) pH 8.3(如果要偶聯(lián)的生物分子為 IgG 時,pH=8.5-9.0),室溫保存。3.數(shù)字4和6代表含糖量,含糖量越低,孔徑越大,4FF,4BB,孔徑是80nm左右,6FF,6BB,孔徑是50nm左右。 |
25 | 抗菌肽純化,等電點是11.17,求推薦合適的純化方案? | 等電點大于6,基本是選擇陽離子填料,陽離子填料上帶負電荷。層析填料分為四大類,凝膠過濾,離子交換,親和,疏水。 |
26 | Ni柱是每次用完后都要清洗再生嗎?(上樣后,淋洗的時候,5ml/min的流速,柱壓在0.22) | 最好是每次洗脫結束后都重新再生一次,如果樣品比較干凈,3-5次后,再掛鎳重生也可以。如果不再生,洗脫后用純水洗,然后再過平衡液,再用20%乙醇保存。如果到了生產(chǎn)級別,建議每使用一次,都清洗,可以增加填料的壽命。 |
27 | Tris、EDTA和硫酸銨對Q Focurose HPR有影響嗎?過柱洗脫的樣品凝固了怎么辦,樣品中有硫酸銨,洗脫液有1M氯化鈉。 | Tris和EDTA影響不用考慮,硫酸銨需要考慮濃度和pH對上樣或洗脫的影響。建議降低洗脫液的氯化鈉濃度為0.5M,洗脫液下來后馬上用不含氯化鈉的洗脫液稀釋(保證pH與洗脫液一致)。另外,柱子要裝成矮胖子而不是細長個,防止因為洗脫過程中局部濃度過大導致蛋白析出。 |
28 | MMC掛上不下來,用2M,KCl都洗不下來,有沒有別的洗脫方法推薦的,還有MMC上面是什么疏水配基? | MMC上是苯基疏水基團,洗脫液鹽濃度范圍是0.5M-2M,建議前期緩沖體系或者上樣體系調(diào)整,讓目的蛋白不要跟填料結合太緊。 |
29 | 客戶反映DEAE FF填料使用后經(jīng)堿處理顏色變黑是什么原因,該怎么處理? | DEAE FF是可以耐酸耐堿的,工作狀態(tài)下可以耐受pH 2-9,保存的話,短期保存可以耐受pH 2-14,長期保存可以耐受pH 2-12。 |
30 | 重力柱如何使用? | 重力柱跟正常的層析相比,原理完全一樣,只是沒有檢測器的配合,所有的收集樣品全憑經(jīng)驗。原則上,凝膠過濾三分之一柱體積收集樣品,收集2-3倍上樣量。其余掛柱的,換洗脫液后1個柱體積開始收集,收2-3個柱體積。 |
31 | 離子交換條件怎樣設定? | 陽離子:pH值低于等電點0.5左右,掛柱模式;pH值高于等電點0.5左右,流穿模式。陰離子:pH值高于等電點0.5左右,掛柱模式;pH值低于等電點0.5左右,流穿模式。 |
32 | 蛋白純化過程中離子填料如何選擇? | 根據(jù)蛋白的等電點,如果蛋白等電點在8左右,采取陽離子掛柱陰離子流穿模式。如果蛋白等電點在6左右,就反過來,采用陰離子掛柱陽離子流穿。掛柱的可以考慮用復合填料MMC或MMA代替。一般都需要用兩根柱子,一陰一陽,一個掛柱模式一個流穿模式。 |
33 | 預活化介質(zhì)偶聯(lián)配基時,偶聯(lián)時間如何確定? | 偶聯(lián)時間要根據(jù)實際反應情況跟蹤控制。一般以上清液中,待偶聯(lián)物質(zhì)濃度不再減小作為偶聯(lián)完成的根據(jù)。拿蛋白來說,即為上清液UV280值不再有明顯的降低,即可認為偶聯(lián)過程已經(jīng)完成。 |
34 | Ni-IDA或者是Ni-IMAC,使用過程中發(fā)現(xiàn)填料變成棕褐色是什么原因? | 是因為填料上的Ni脫落,并在堿性環(huán)境中發(fā)生化學反應生成氫氧化鎳沉淀所致。一般可以用0.1M的EDTA緩慢沖洗兩小時以求復原。 |
35 | 填料該如何保存? | 親和填料,一般2-8度保存,其余填料,室溫陰暗保存。不能凍結。一旦結冰凍結,復融時填料基質(zhì)有可能會破碎。 |
樣品處理與檢測方面 | ||
序號 | 客戶問題 | 匯研答案 |
1 | 之前用你們匯研的proteinA和G兩種試用裝對人的血液抗體A進行純化,用平衡液一沖就全出來了,后面再用洗脫液洗脫的時候不出峰了,上樣1ml,緩沖液PB的PH7.4,流速0.5ml/min,儲存溶液用的PH7.2的PB,鹽濃度用的0.02M,是什么原因?qū)е碌模?/span> | 出現(xiàn)這種情況可能有這幾個原因:1.1ml的樣品中對應的抗體濃度大約6.9至7mg/ml的話,人血清中純化抗體濃度和量較低,洗脫液中抗體濃度低于檢測下限,建議人血清樣品增加上樣倍數(shù)至40倍以上(稀釋后的上樣體積,人血清體積3-5倍) 2.確認一下樣品上樣前的條件,主要是PH和電導,建議用平衡液稀釋10倍以上,復測PH和電導的差異(平衡液稀釋后PH和電導差異較小,不用調(diào)整) |
2 | 我們的樣本含有40mM咪唑可以上離子交換柱嗎?用的你們匯研的SP,樣本含有40mM咪唑,1mMPMSF,1mM-EM,2mMDTT,這個帶10個his標簽的蛋白超聲時得有500mM鹽,一定要先透析掉鹽再上柱嗎? | 1 、高鹽對于超聲破碎的影響比較小,主要是看蛋白的穩(wěn)定性。所以關注點不是高鹽超聲破碎,而是上柱的填料對送溶液電導的要求,例如,過SP預裝柱,可以低鹽超聲破碎也可以高鹽超聲破碎,但是上樣前需要檢測電導,如果高于10mS/cm,需要對樣品緩沖液置換透析或直接加上柱平衡液進行稀釋電導至10mS/cm以下。 |
3 | 我們是做DNA聚合酶的表達純化,目前是用鎳柱進行純化,純化后純度很純,基本只有一條目的蛋白,然后過肝素柱子的目的是想把基因組DNA去除,但是過完肝素柱子除了目的蛋白,還出現(xiàn)了疑似目的蛋白的二聚體,而且只用肝素柱子一步純化,純度差,還有一個問題是用肝素柱子的時候好多蛋白不掛柱,你們匯研有這方面的例子嗎?我們的目標蛋白是DNA聚合酶,理論上是結合肝素的,這方面優(yōu)化平衡液和樣品填料能實現(xiàn)最終純化嗎? | 肝素是親和填料,只對特定目標物結合,不是所有蛋白都結合,如果目標物不結合或結合量很少,需要優(yōu)化平衡液和樣品的條件,讓樣品和填料充分結合。可以的,但是看客戶的純度要求,純度要求非常高的話還是建議兩步或兩步以上純化。 |
4 | 我們用的桿狀病毒表達系統(tǒng),之前掛柱效果不理想,這次將His標簽長度增加到10個了,這種情況推薦哪一款鎳柱呀?之前用過GE的填料,普通的那種,也用過你們匯研的耐EDTA的那種預裝柱TED。 | TED的載量最低,但是耐EDTA。如果可以用普通的Ni柱,不需要耐EDTA的話,可以用IMAC試試。 |
5 | 在細胞里擴增病毒,如何能更好的和細胞成分分離開?離心的時候有很多病毒被帶到沉淀里 | 如果有遇到很多病毒被帶到沉淀里,且病毒濃度不大的話,那么可能是在由感染細胞或組織勻漿中提取病毒時,由于與病毒大小相近的細胞亞單位及碎片的存在,導致提純效果不理想。 |
6 | DNA聚合酶純化后,要檢測這個基因組DNA殘留,該怎么檢測? | 定性的話就用DNA電泳試試,定量就麻煩些,用同位素法或者做熒光定量pcr。 |
7 | G50和G75 這幾款葡聚糖配合重力柱試用,需要額外加壓嗎? | 重力柱不能加壓,用重力柱做G75一類的這些東西的拖延或者緩沖液置換,就是算體積的,核心的思想就是你的樣品的進去測,你看好柱體積,1/3個柱體積開始收集,就是1/3柱體積開始出峰,理論就是這樣子。如果你的柱子是四毫升,那就是3.3毫升,你下面看到過了3.3毫升之后開始收,大概收個幾毫升吧,可以首兩個至一個體積左右,你上樣量大概翻個三倍左右,你上一毫升就收三毫升以上,兩毫升就收六毫升,差不多就是這樣一個范圍,重力柱的話完全就是憑經(jīng)驗做的,沒有任何檢測就是在線檢測的。 |
8 | 1,將高親和力的單抗偶聯(lián)到填料中,純化樣品中的特異性蛋白,請問你們匯研目前有沒有做過中試規(guī)模的例子可供分享?2.人源化抗體好偶聯(lián)嗎?3.這種偶聯(lián)填料都裝多大的柱子,如果處理樣品量比較大,你們能不能做? | 我們有做過納米抗體偶聯(lián)的項目,做過幾十升中試規(guī)模的。您那邊方便的可以把抗體寄過來,我們幫您偶聯(lián),可能前期要做一個基質(zhì)微球的篩選。 |
9 | 豬腹瀉全病毒純化:1.滅活前還是滅活后純化?2.收率多少,檢測方法是什么?3.色素問題? | 1.兩種方式都有,要根據(jù)具體的工藝具體安排。2.兩種純化方案收率不同,要根據(jù)自己的產(chǎn)品情況選擇。檢測方法是客戶提供的,不方便透露。3.色素是后洗脫出來的。 |
10 | 病毒被帶到沉淀里怎能辦? | 如果有遇到很多病毒被帶到沉淀里,且病毒濃度不大的話,那么可能是在由感染細胞或組織勻漿中提取病毒時,由于與病毒大小相近的細胞亞單位及碎片的存在,導致提純效果不理想。 |
11 | 怎樣鑒定樣品中的二聚體? | 用我們的分子篩填料,分辨率不夠很難鑒定出來。建議用HPLC,根據(jù)分子量范圍選擇一根合適的分子篩柱子,在目標蛋白峰前面出的小峰即為二聚體。 |
裝柱方面 | ||
序號 | 客戶問題 | 匯研答案 |
1 |
柱子出現(xiàn)漏液是什么原因? | 閥門、密封圈沒擰緊,管路破損 |
2 |
凝膠出現(xiàn)裂縫是什么原因? | 氣泡進入層析柱,需重裝 |
3 |
柱子分辨率降低,分離效果不好是什么原因? | 柱效不合格; 流速過快(30cm/h); 上樣量過大(組群分離≤30%、精細分離 ≤0.5 -4.0%); 層析柱使用時間過長,凝膠出現(xiàn)結塊需重裝 |
4 |
凝膠發(fā)黃是什么原因? | 使用時間過長; 清洗不夠徹底 (1M NaOH/2% Triton X100/20%乙醇/30%異丙醇等清洗) |
5 | 峰形圖前傾/拖尾是什么情況? | 前傾(AS<1.0):過緊;拖尾:過松(AS>1.0) |
6 |
反壓過大是什么原因? | 凝膠堵塞; 層析系統(tǒng)管路/進樣頭/在線過濾器堵 塞; 裝柱過緊; 凝膠破碎; |
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